Tugas : Tugas pokok MAN 5 Bojonegoro adalah menyelenggarakan pendidikan di bidang agama, ilmu pengetahuan, teknologi dan seni yang bercirikan Islam, sesuai dengan peraturan perundang-undangan yang berlaku serta visi dan misi MAN 5 Bojonegoro. Dalam mewujudkan tugas pokok tersebut MAN 5 Bojonegoro telah menerapkan visi dan misi serta program kerja yang dijadikan pedoman dalam menjalankan kinerja kelembagaan. Kinerja kelembagaan akan berjalan secara efektif apabila MAN 5 Bojonegoro mampu mengedepankan aspek akuntabilitas dan mampu memberikan penilaian secara obyektif terhadap kinerja lembaga. Kedudukan tersebut membawa konsekuensi yang harus disikapi secara arif olehpimpinan MAN 5 Bojonegoro dan jajaran pejabat yang terkait di Kementerian Agama sehingga langkah-langkah yang diambil dapat sejalan dengan tugas pokok dan fungsi Kementerian Agama.

Fungsi : Dalam menjalankan tugasnya, MAN 5 Bojonegoro menyelenggarakan fungsi :

1. Melaksanakan pendidikan tingkat aliyah/menengah sesuai kurikulum yang berlaku;
2. Melaksanakan pendidikan tingkat aliyah/menengah atas sesuia kurikulum yang berlaku;
3. Melaksanakan bimbingan dan penyuluhan bagi para siswa;
4. Membina kerjasama dengan orang tua siswa dan masyarakat;
5. Melaksanakan tata usaha dan rumah tangga Madrasah termasuk perpustakaan dan laboratorium;

Sebagai penjabaran visi dan misi, tujuan pembangunan MAN 5 Bojonegoro :

Bidang Kurikulum :

1. ....................
2. ....................
3. ....................
4. ....................
5. ....................

Bidang Kesiswaan :

1. ....................
2. ....................
3. ....................
4. ....................
5. ....................

Bidang Hubungan Masyarakat :

1. ....................
2. ....................
3. ....................
4. ....................
5. ....................

Bidang Sarana Prasarana :

1. ....................
2. ....................
3. ....................
4. ....................
5. ....................

1. Bintang bersudut lima yang melambangkan sila Ketuhanan Yang Maha Esa dalam Pancasila, bermakna bahwa karyawan Kementerian Agama selalu menaati dan menjunjung tinggi norma-norma agama dalam melaksanakan tugas Pemerintahan dalam Negara Republik Indonesia yang berdasarkan Pancasila.
2. 17 kuntum bunga kapas, 8 baris tulisan dalam Kitab Suci dan 45 butir padi bermakna Proklamasi Kemerdekaan republik Indonesia pada tanggal 17 Agustus 1945, menunjukkan kebulatan tekad para Karyawan Kementerian Agama untuk membela Kemerdekaan Negara Kesatuan republik Indonesia yang diproklamirkan pada tanggal 17 Agustus 1945.
3. Butiran Padi dan Kapas yang melingkar berbentuk bulatan bermakna bahwa Karyawan Kementerian Agama mengemban tugas untuk mewujudkan masyarakat yang sejahtera, adil, makmur dan merata.
4. Kitab Suci bermakna sebagai pedoman hidup dan kehidupan yang serasi antara kebahagiaan duniawi dan ukhrawi, materil dan spirituil dengan ridha Allah SWT Tuhan Yang Maha Esa.
5. Alas Kitab Suci bermakna bahwa pedoman hidup dan kehidupan harus ditempatkan pada proporsi yang sebenarnya sesuai dengan potensi dinamis dari Kitab Suci.
6. Kalimat “Ikhlas Beramal” bermakna bahwa Karyawan Kementerian Agama dalam mengabdi kepada masyarakat dan Negara berlandaskan niat beribadah dengan tulus dan ikhlas.
7. Perisai yang berbentuk segi lima sama sisi dimaksudkan bahwa kerukunan hidup antar umat beragama RI yang berdasarkan Pancasila dilindungi sepenuhnya sesuai dengan Undang-Undang Dasar 1945.
8. Kelengkapan makna lambang Kementerian Agama melukiskan motto : Dengan Iman yang teguh dan hati yang suci serta menghayati dan mengamalkan Pancasila yang merupakan tuntutan dan pegangan hidup dalam kehidupan bermasyarakat dan bernegara, karyawan Kementerian Agama bertekad bahwa mengabdi kepada Negara adalah Ibadah.

( Lambang Kementerian Agama Berdasarkan Keputusan Menteri Agama Nomor : 717 Tahun 2006 )